Mercurio total en hígado de Trachemys callirostris (Gray, 1856) (Testudines: Emydidae) en tres zonas de la Mojana, Sucre-Colombia / Total mercury in liver of Trachemys callirostris (Gray, 1856) (Testudines: Emydidae) in three areas of la Mojana, Sucre-Colombia

RESUMEN La región de la Mojana, perteneciente a la depresión Momposina, que se encuentra en el norte colombiano, desde hace muchos años, ha estado presentando problemáticas ambientales, asociadas a los metales pesados, en principio, por mercurio que, potencialmente, está afectando la fauna silvestre, en especial, a Trachemys callirostris. Esta especie categorizada como vulnerable, se encuentra amenazada, esencialmente, por la sobreexplotación y la alteración de su hábitat. El objetivo de este estudio fue determinar las concentraciones de mercurio total en hígado de la hicotea T. callirostris en tres localidades del departamento de Sucre, pertenecientes a la región de la Mojana. Los individuos, se obtuvieron, de manera directa, de pescadores de subsistencia, en los municipios de San Marcos, Caimito y Guaranda. Se tomaron muestras de hígado de 35 individuos de T. callirostris y se cuantificaron las concentraciones de mercurio total, por el método de Espectrometría de Absorción Atómica, usando un analizador directo de mercurio, con previos tratamientos de las muestras. Los resultados mostraron diferencias significativas entre los sitios muestreados (p<0,05) en las concentraciones de mercurio. Las concentraciones de mercurio encontradas en este estudio demuestran el potencial riesgo ambiental para las especies que comparten este hábitat, en especial, las de consumo humano.

ABSTRACT The Mojana region, belonging to the Momposina depression in northern Colombia, presents environmental problems associated with heavy metals for many years, mainly due to mercury, which is potentially affecting wildlife, especially Trachemys callirostris. This species categorized as vulnerable, is mainly threatened by overexploitation and alteration of its habitat. The objective of this study was to determine the concentrations of total mercury in the liver of the hicotea T. callirostris in three locations in the department of Sucre belonging to the Mojana region. Turtles were obtained directly from subsistence fishermen from towns San Marcos, Caimito and Guaranda. Liver samples were taken from 35 individuals of T. callirostris and total mercury concentrations were also quantified by the Atomic Absorption Spectrometry method, using a mercury direct analyzer with previous sample treatments. The results showed significant differences between the sampled sites (p <0.05) in mercury concentrations. The mercury concentrations found in this study demonstrate the potential environmental risk for the species that share this habitat, especially those for human consumption.

Complete Colombian Caribbean loggerhead turtle mitochondrial genome: tRNA structure analysis and revisited marine turtle phylogeny / Genoma mitocondrial completo de la tortuga caguama del Caribe colombiano: análisis de la estructura del tRNA y revisión de la filogenia de las tortugas marinas / Genoma mitocondrial de tartaruga-cabeçuda do Caribe colômbiano completo: análise de estrutura de tRNA e filogenia revisada de tartarugas marinhas

Abstract The loggerhead marine turtle, Caretta caretta, is a widely distributed and endangered species that is facing critical population decline, especially in Colombian Caribbean rookeries. Mitochondrial DNA sequence data are of great importance for the description, monitoring, and phylogenetic analyses of migratory turtle populations. In this study, the first full mitochondrial genome of a loggerhead turtle nesting in the Colombian Caribbean was sequenced and analyzed. This mitochondrial genome consists of 16 362 bp with a nucleotide composition of T: 25.7 %, C: 27 %, A: 35 % and G: 12 %. Sequence annotation of the assembled molecule revealed an organization and number of coding and functional units as reported for other vertebrate mitogenomes. This Colombian loggerhead turtle (Cc-AO-C) showed a novel D-Loop haplotype consisting of thirteen new variable sites, sharing 99.2 % sequence identity with the previously reported Caribbean loggerhead CC-A1 D-Loop haplotype. All 13 protein-coding genes in the Cc-AO-C mitogenome were compared and aligned with those from four other loggerhead turtles from different locations (Florida, Greece, Peru, and Hawaii). Eleven of these genes presented moderate genetic diversity levels, and genes COII and ND5 showed the highest diversity, with average numbers of pair-wise differences of 16.6 and 25, respectively. In addition, the first approach related to t-RNAs 2D and 3D structure analysis in this mitogenome was conducted, leading to observed unique features in two tRNAs (tRNATrp and tRNALeu). The marine turtle phylogeny was revisited with the newly generated data. The entire mitogenome provided phylogenetically informative data, as well as individual genes ND5, ND4, and 16S. In conclusion, this study highlights the importance of complete mitogenome data in revealing gene flow processes in natural loggerhead turtle populations, as well as in understanding the evolutionary history of marine turtles.

Resumen La tortuga marina caguama, Caretta caretta, es una especie ampliamente distribuida pero que enfrenta una crítica reducción de su población en las colonias del Caribe colombiano. Los datos de las secuencias de DNA mitocondrial son de gran importancia para la descripción, monitoreo y análisis de la filogenia de las tortugas migratorias. En este estudio se secuenció y analizó por primera vez el genoma mitocondrial completo de la tortuga caguama que anida en el Caribe colombiano. Este genoma tiene un tamaño de 16.362 pb con una composición de nucleótidos de T: 25.7 %, C: 27 %, A: 35 % y G: 12 %. La anotación de la secuencia de la molécula reveló una organización y número de unidades codificantes y funcionales como los reportados para mitogenomas de otros vertebrados. Esta tortuga caguama colombiana (Cc-AO-C) mostró un nuevo haplotipo D-Loop que contiene trece nuevos sitios variables, que comparten el 99.2 % de identidad de secuencia con el haplotipo CC-A1 D-Loop previamente reportado para la tortuga caguama del Caribe. Los trece genes que codifican proteínas en el mitogenoma Cc-AO-C se compararon y alinearon con los de otras cuatro tortugas caguama de distintas localidades (Florida, Grecia, Perú y Hawái). Once de estos genes presentaron niveles moderados de diversidad genética, y los genes COII y ND5 mostraron las diversidades nucleotídicas más altas, con un número promedio de diferencias entre pares de secuencias de 6.6 y 25, respectivamente. Adicionalmente, se llevó a cabo la primera aproximación relacionada con el análisis de la estructura 2D y 3D de t-RNAs en este mitogenoma, lo cual condujo a la observación de características únicas en dos tRNAs (tRNATrp y tRNALeu). La filogenia de las tortugas marinas fue revisada a la luz de la nueva información mitogenómica. El mitogenoma, así como los genes individuales ND5, ND4 y 16S, proporcionan datos filogenéticamente informativos. En conclusión, este estudio resalta la importancia de los datos del mitogenoma para revelar procesos de flujo génico en las poblaciones naturales de tortuga caguama, así como para entender la historia evolutiva de las tortugas marinas.

Resumo A tartaruga marinha Caretta caretta (Cc) é uma espécie amplamente distribuída e ameaçada de extinção que enfrenta um declínio crítico da população, especialmente nas colônias do Caribe colombiano. Marcadores moleculares, como sequências de DNA mitocondrial (mtDNA), são de grande importância para a descrição, monitoramento e análise filogenética de populações migratórias de tartarugas. Este estudo mostra a obtenção e análise do genoma mitocondrial de uma tartaruga-cabeçal Cc aninhada na costa Caribe da Colômbia. O genoma mitocondrial é constituído por 16.362 pb, com uma região não codificante (D-Loop), 13 genes codificadores de proteínas (13 PCG), 22 genes tRNA e 2 rRNA (16S e 12S) e uma frequência nucleotídica de T: 25.7 % , C: 27 %, A: 35 % e G: 12,2 %, todos organizados de forma semelhante à maioria dos mitogenomos de vertebrados. Esta tartaruga Cc colombiana apresentou um novo haplótipo D-Loop com treze sítios polimórficos quando comparado ao haplótipo CC-A1.1 (96 %). Além disso, onze genes codificadores de proteínas entre as tartarugas marinhas de diferentes origens apresentaram uma diversidade genética semelhante, exceto os genes COII e ND5 que apresentaram o maior número médio de diferenças entre pares de seqüências (16.600 e 25.000, respectivamente). Aqui relatase a primeira abordagem relacionada à análise de estruturas 2D e 3D para Cc e descrevese as diferenças em dois tRNAs (tRNATrp, tRNALeu). As inferências bayesianas e os métodos de máxima verossimilhança explicam melhor a filogenia das tartarugas marinhas quando utilizamse mitogenomes completos, assim como os genes ND5, ND4 e 16S. Os genes marcadores ATP8, ND4L e ND1 apresentaram relação filogenética pouco suportada. Como conclusão, este estudo apresenta o uso de mitogenomes completos como uma alternativa para melhorar a análise filogenética em tartarugas marinhas e é a primeira análise genética de mitogenomes completos de nidificação na Colômbia.

Anidación y conservación de la tortuga lora (Lepidochelys olivacea) en playa Drake, península de Osa, Costa Rica (2006 a 2012) / Nesting and conservation of the Olive Ridley sea turtle (Lepidochelys olivacea) in playa Drake, Osa Peninsula, Costa Rica (2006-2012)

Resumen Desde 2006 a 2012, la anidación de la tortuga lora (Lepidochelys olivacea) fue monitoreada en bahía Drake, un enclave reconocido internacionalmente por su excelente oferta eco-turística que se localiza en la región noroeste de la península de Osa. Sorprendentemente, esta área dispone de playas de anidación solitaria de tortuga lora que han permanecido casi desadvertidas hasta fechas recientes. Durante este periodo de monitoreo, 958 nidos fueron registrados en playa Drake (promedio anual: 136.9; densidad: 3.80 nidos/100m de playa), de los cuales 363 (37.9%) fueron reubicados a un vivero. Antes de 2006, la pérdida anual de nidos fue superior al 85% debido al saqueo en playa; desde 2006, el porcentaje del saqueo de nidos se mantuvo en un promedio del 10.1%. Además, un total de 335 hembras fueron identificadas con placas metálicas; el promedio de la longitud curva del caparazón fue de 66.1cm; el promedio del ancho curvo del caparazón fue de 70.2cm, y el tamaño promedio por nidada fue de 96.3 huevos. El promedio del éxito de eclosión para los nidos reubicados en vivero fue de 79.2%, y más de 61 000 neonatos fueron liberados al mar durante este periodo. Este proyecto es un ejemplo de una iniciativa exitosa de conservación, eco-turismo y desarrollo comunitario.

Abstract The nesting of the Olive Ridley (Lepidochelys olivacea) sea turtle was studied from 2006 to 2012 in Drake Bay, Costa Rica, an important solitary nesting site and center of eco-tourism in the Osa Peninsula. During this period, 958 nests were recorded (mean: 136.9 nests per season; density: 3.8 nests/100m of beach per season), of which 38% were relocated to a hatchery. The incidence of poaching was reduced from 85% in 2005 to a mean of 10.1% from 2006-2012. A total of 335 nesting females were tagged; the mean curved length of carapace was 66.1cm, the mean curved width was 70.2cm, and the mean number of eggs per nest was 96.3. A mean rate of reproductive success of 79.2% was obtained and over 61 000 hatchlings were liberated from the hatchery. This project is an example of a successful community-based conservation and eco-tourism initiative. Rev. Biol. Trop. 63 (Suppl. 1): 117-129. Epub 2015 April 01.

Turtle cleaners: reef fishes foraging on epibionts of sea turtles in the tropical Southwestern Atlantic, with a summary of this association type

In the present study we record several instances of reef fish species foraging on epibionts of sea turtles (cleaning symbiosis) at the oceanic islands of Fernando de Noronha Archipelago and near a shipwreck, both off the coast of Pernambuco State, northeast Brazil. Nine reef fish species and three turtle species involved in cleaning are herein recorded. Besides our records, a summary of the literature on this association type is presented. Postures adopted by turtles during the interaction are related to the habits of associated fishes. Feeding associations between fishes and turtles seem a localized, albeit common, phenomenon.

No presente estudo registramos diversos episódios de peixes recifais alimentando-se de epibiontes sobre o corpo de tartarugas marinhas (simbiose de limpeza) nas ilhas oceânicas do arquipélago de Fernando de Noronha e próximo a um naufrágio na costa de Pernambuco, nordeste do Brasil. Nove espécies de peixes recifais e três espécies de tartarugas envolvidas nas associações são aqui registradas. Além de nossos registros, apresentamos também um resumo da literatura sobre o tema. As posturas adotadas pelas tartarugas durante as interações estão relacionadas com os hábitos dos peixes associados. Associações alimentares entre peixes e tartarugas podem ser consideradas como um fenômeno local, embora comum.